Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms