Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN12Q6ZSI9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 275.8 ms