Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.237e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 TRAP1-211ENST00000574941 558 ntTSL 416.46■□□□□ 0.227e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.227e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.212e-12■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 LINC01089-201ENST00000428029 1024 ntTSL 216.26■□□□□ 0.192e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.197e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.197e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 RUNX1-216ENST00000482318 1710 ntTSL 1 (best)16.2■□□□□ 0.187e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 LINC01089-210ENST00000543167 1059 ntTSL 216.06■□□□□ 0.162e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 PAN3-204ENST00000503791 2443 ntTSL 216.06■□□□□ 0.162e-10■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 RAD23A-204ENST00000588329 1034 ntTSL 515.96■□□□□ 0.152e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 BMP2K-202ENST00000389010 2741 ntTSL 1 (best)15.81■□□□□ 0.127e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.112e-12■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.12e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 ZC3H3-202ENST00000528401 546 ntTSL 315.68■□□□□ 0.17e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.097e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.082e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 TANGO2-226ENST00000490583 888 ntTSL 315.19■□□□□ 0.022e-12■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.012e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.022e-12■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 C1orf35-203ENST00000469781 2256 ntTSL 214.88□□□□□ -0.032e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.077e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.092e-10■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 RIPOR3-206ENST00000488529 953 ntTSL 514.43□□□□□ -0.17e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 SSBP4-213ENST00000602088 622 ntTSL 514.42□□□□□ -0.17e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 KDM4B-210ENST00000592175 562 ntTSL 414.22□□□□□ -0.133e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 RHOF-206ENST00000545544 826 ntTSL 514.13□□□□□ -0.152e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 TAMM41-202ENST00000411947 1078 ntTSL 214.08□□□□□ -0.167e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.162e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 PRKCA-203ENST00000578063 1733 ntTSL 1 (best)14.07□□□□□ -0.167e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 RHOF-205ENST00000541657 1626 ntTSL 514.04□□□□□ -0.162e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 TANGO2-203ENST00000399807 2241 ntTSL 513.98□□□□□ -0.172e-12■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 LENG8-203ENST00000421200 594 ntTSL 313.62□□□□□ -0.237e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.247e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.292e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.37e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.312e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 RAD23A-210ENST00000593114 1691 ntTSL 513.08□□□□□ -0.322e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 GNB2-210ENST00000451587 887 ntTSL 512.97□□□□□ -0.337e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.357e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.362e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.412e-12■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 TANGO2-213ENST00000444651 847 ntTSL 312.46□□□□□ -0.412e-12■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 TAMM41-210ENST00000494388 1036 ntTSL 212.17□□□□□ -0.467e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 TANGO2-224ENST00000485715 617 ntTSL 512.11□□□□□ -0.472e-12■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 LINC01089-208ENST00000541694 875 ntTSL 212.1□□□□□ -0.472e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 RAD23A-205ENST00000588826 832 ntTSL 512.09□□□□□ -0.472e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.57e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.547e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.557e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.597e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.617e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.647e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 AP001347.1-203ENST00000448463 780 ntTSL 210.98□□□□□ -0.657e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 SLC2A3-208ENST00000541671 590 ntTSL 210.97□□□□□ -0.657e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.662e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.677e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 AL117379.1-201ENST00000619319 677 ntBASIC10.75□□□□□ -0.697e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 TRAPPC12-207ENST00000433382 578 ntTSL 510.7□□□□□ -0.72e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.717e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.732e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.742e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.747e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 C1orf35-204ENST00000472617 3554 ntTSL 210.39□□□□□ -0.752e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 HIRA-203ENST00000452818 453 ntTSL 510.34□□□□□ -0.752e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.777e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 C1RL-208ENST00000543933 592 ntTSL 510.18□□□□□ -0.787e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 C1RL-209ENST00000543941 539 ntTSL 310.18□□□□□ -0.787e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 TRAPPC12-217ENST00000473348 491 ntTSL 59.99□□□□□ -0.812e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.812e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 TRAPPC12-206ENST00000417243 1047 ntTSL 59.92□□□□□ -0.822e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 TRAPPC12-204ENST00000415624 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.78□□□□□ -0.842e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 SPDL1-206ENST00000507232 2144 ntTSL 1 (best)9.52□□□□□ -0.897e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 C1RL-205ENST00000537833 561 ntTSL 39.47□□□□□ -0.897e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 C1RL-204ENST00000534969 532 ntTSL 39.47□□□□□ -0.897e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 CDYL-208ENST00000483019 773 ntTSL 29.41□□□□□ -0.97e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.927e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.947e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 ZC3H3-201ENST00000262577 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.967e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 TAMM41-206ENST00000455809 1213 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.977e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.977e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.977e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 TAMM41-204ENST00000417723 992 ntTSL 1 (best)8.89□□□□□ -0.997e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 TRAPPC12-213ENST00000461577 677 ntTSL 28.82□□□□□ -12e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 TRAP1-216ENST00000576335 645 ntTSL 58.81□□□□□ -17e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -17e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 NUMA1-220ENST00000541584 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)8.73□□□□□ -1.012e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 C1RL-211ENST00000545280 449 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.037e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.067e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 RFC1-210ENST00000505077 566 ntTSL 48.37□□□□□ -1.077e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.077e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 NOC2L-203ENST00000477976 4201 ntTSL 58.36□□□□□ -1.072e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.087e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 TRAP1-206ENST00000571538 587 ntTSL 48.2□□□□□ -1.17e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 SPDL1-201ENST00000265295 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.17e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 CDYL-204ENST00000440139 690 ntTSL 37.98□□□□□ -1.137e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 RIPOR3-201ENST00000045083 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.137e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 SLC7A5-203ENST00000565644 3983 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.152e-7■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.167e-6■■□□□ 12.9
NIPBLQ6KC79 SSBP4-208ENST00000600628 550 ntTSL 37.77□□□□□ -1.177e-6■■□□□ 12.9
Retrieved 100 of 8,528 protein–RNA pairs in 60.7 ms