Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN3Q4LDR2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms