Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IMPG1Q17R60 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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