Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PFKFB3Q16875 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFKFB3Q16875 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms