Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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