Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL4AQ13619 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL4AQ13619 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
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