Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2orf54Q08AI8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms