Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms