Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PDE1BQ01064 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE1BQ01064 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE1BQ01064 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PDE1BQ01064 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PDE1BQ01064 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE1BQ01064 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PDE1BQ01064 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1BQ01064 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1BQ01064 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1BQ01064 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1BQ01064 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1BQ01064 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1BQ01064 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1BQ01064 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1BQ01064 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1BQ01064 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1BQ01064 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1BQ01064 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1BQ01064 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1BQ01064 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1BQ01064 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE1BQ01064 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE1BQ01064 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE1BQ01064 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE1BQ01064 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE1BQ01064 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE1BQ01064 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE1BQ01064 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE1BQ01064 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE1BQ01064 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE1BQ01064 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDE1BQ01064 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE1BQ01064 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE1BQ01064 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE1BQ01064 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE1BQ01064 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1BQ01064 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1BQ01064 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1BQ01064 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1BQ01064 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1BQ01064 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1BQ01064 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1BQ01064 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1BQ01064 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1BQ01064 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDE1BQ01064 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1BQ01064 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1BQ01064 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1BQ01064 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1BQ01064 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1BQ01064 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1BQ01064 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1BQ01064 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1BQ01064 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1BQ01064 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1BQ01064 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1BQ01064 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1BQ01064 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1BQ01064 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms