Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC5Q00444 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms