Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMF1P82094 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMF1P82094 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMF1P82094 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMF1P82094 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMF1P82094 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMF1P82094 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMF1P82094 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TMF1P82094 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMF1P82094 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMF1P82094 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMF1P82094 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMF1P82094 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMF1P82094 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TMF1P82094 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMF1P82094 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TMF1P82094 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMF1P82094 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMF1P82094 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMF1P82094 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMF1P82094 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMF1P82094 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TMF1P82094 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMF1P82094 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMF1P82094 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMF1P82094 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMF1P82094 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMF1P82094 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TMF1P82094 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMF1P82094 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMF1P82094 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMF1P82094 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMF1P82094 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMF1P82094 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMF1P82094 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMF1P82094 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMF1P82094 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMF1P82094 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMF1P82094 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TMF1P82094 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMF1P82094 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMF1P82094 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMF1P82094 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMF1P82094 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TMF1P82094 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMF1P82094 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMF1P82094 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMF1P82094 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMF1P82094 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMF1P82094 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMF1P82094 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMF1P82094 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMF1P82094 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMF1P82094 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TMF1P82094 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMF1P82094 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMF1P82094 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMF1P82094 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMF1P82094 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMF1P82094 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMF1P82094 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMF1P82094 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMF1P82094 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMF1P82094 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMF1P82094 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMF1P82094 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMF1P82094 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMF1P82094 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMF1P82094 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMF1P82094 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMF1P82094 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMF1P82094 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMF1P82094 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMF1P82094 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMF1P82094 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMF1P82094 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMF1P82094 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TMF1P82094 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMF1P82094 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMF1P82094 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMF1P82094 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMF1P82094 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMF1P82094 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMF1P82094 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMF1P82094 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMF1P82094 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMF1P82094 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMF1P82094 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMF1P82094 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMF1P82094 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMF1P82094 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMF1P82094 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMF1P82094 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TMF1P82094 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMF1P82094 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMF1P82094 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMF1P82094 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMF1P82094 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMF1P82094 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMF1P82094 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms