Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms