Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEFA3P59666 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA3P59666 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms