Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX9P55771 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX9P55771 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX9P55771 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX9P55771 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX9P55771 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX9P55771 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX9P55771 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX9P55771 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX9P55771 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX9P55771 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX9P55771 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX9P55771 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX9P55771 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX9P55771 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX9P55771 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX9P55771 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX9P55771 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX9P55771 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX9P55771 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX9P55771 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX9P55771 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX9P55771 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX9P55771 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX9P55771 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX9P55771 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX9P55771 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX9P55771 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX9P55771 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX9P55771 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX9P55771 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX9P55771 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX9P55771 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX9P55771 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX9P55771 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX9P55771 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX9P55771 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX9P55771 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX9P55771 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX9P55771 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX9P55771 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX9P55771 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX9P55771 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX9P55771 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX9P55771 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX9P55771 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX9P55771 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX9P55771 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX9P55771 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX9P55771 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX9P55771 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX9P55771 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX9P55771 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX9P55771 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX9P55771 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX9P55771 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX9P55771 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX9P55771 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX9P55771 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX9P55771 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX9P55771 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX9P55771 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX9P55771 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX9P55771 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX9P55771 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX9P55771 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX9P55771 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX9P55771 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX9P55771 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX9P55771 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX9P55771 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX9P55771 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX9P55771 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX9P55771 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX9P55771 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX9P55771 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX9P55771 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX9P55771 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX9P55771 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX9P55771 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX9P55771 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX9P55771 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX9P55771 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX9P55771 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX9P55771 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX9P55771 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX9P55771 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX9P55771 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX9P55771 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX9P55771 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX9P55771 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX9P55771 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX9P55771 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX9P55771 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX9P55771 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX9P55771 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX9P55771 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX9P55771 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX9P55771 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX9P55771 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms