Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC8P31273 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms