Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5DP30049 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms