Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT1P21579 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT1P21579 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT1P21579 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT1P21579 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT1P21579 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT1P21579 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT1P21579 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT1P21579 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT1P21579 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT1P21579 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT1P21579 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT1P21579 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT1P21579 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT1P21579 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT1P21579 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT1P21579 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT1P21579 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT1P21579 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT1P21579 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT1P21579 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT1P21579 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT1P21579 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT1P21579 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT1P21579 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT1P21579 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT1P21579 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT1P21579 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT1P21579 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT1P21579 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT1P21579 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT1P21579 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT1P21579 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT1P21579 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT1P21579 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT1P21579 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT1P21579 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT1P21579 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT1P21579 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT1P21579 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT1P21579 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT1P21579 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT1P21579 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT1P21579 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT1P21579 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT1P21579 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT1P21579 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT1P21579 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT1P21579 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT1P21579 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT1P21579 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT1P21579 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT1P21579 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT1P21579 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT1P21579 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT1P21579 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT1P21579 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT1P21579 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT1P21579 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT1P21579 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT1P21579 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT1P21579 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT1P21579 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT1P21579 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT1P21579 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT1P21579 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT1P21579 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT1P21579 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT1P21579 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT1P21579 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT1P21579 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT1P21579 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT1P21579 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT1P21579 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT1P21579 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT1P21579 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT1P21579 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT1P21579 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT1P21579 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT1P21579 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT1P21579 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT1P21579 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT1P21579 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT1P21579 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT1P21579 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT1P21579 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT1P21579 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYT1P21579 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYT1P21579 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT1P21579 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT1P21579 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT1P21579 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT1P21579 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT1P21579 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT1P21579 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT1P21579 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT1P21579 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT1P21579 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT1P21579 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT1P21579 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms