Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM225BP0DP42 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms