Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24AO95486 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms