Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAPBO95292 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAPBO95292 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAPBO95292 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPBO95292 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPBO95292 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPBO95292 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPBO95292 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPBO95292 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPBO95292 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPBO95292 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPBO95292 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPBO95292 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPBO95292 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPBO95292 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPBO95292 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPBO95292 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPBO95292 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPBO95292 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPBO95292 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPBO95292 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPBO95292 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPBO95292 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPBO95292 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPBO95292 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPBO95292 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAPBO95292 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAPBO95292 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAPBO95292 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAPBO95292 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAPBO95292 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAPBO95292 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAPBO95292 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAPBO95292 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAPBO95292 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAPBO95292 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAPBO95292 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAPBO95292 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAPBO95292 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAPBO95292 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAPBO95292 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAPBO95292 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAPBO95292 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAPBO95292 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAPBO95292 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAPBO95292 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAPBO95292 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAPBO95292 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAPBO95292 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAPBO95292 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAPBO95292 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAPBO95292 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAPBO95292 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAPBO95292 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
VAPBO95292 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
VAPBO95292 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
VAPBO95292 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
VAPBO95292 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAPBO95292 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAPBO95292 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAPBO95292 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAPBO95292 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAPBO95292 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAPBO95292 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAPBO95292 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAPBO95292 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAPBO95292 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAPBO95292 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAPBO95292 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAPBO95292 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAPBO95292 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAPBO95292 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAPBO95292 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
VAPBO95292 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21■□□□□ 0.95
VAPBO95292 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VAPBO95292 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VAPBO95292 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VAPBO95292 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VAPBO95292 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VAPBO95292 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
VAPBO95292 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VAPBO95292 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VAPBO95292 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAPBO95292 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAPBO95292 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAPBO95292 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAPBO95292 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAPBO95292 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAPBO95292 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAPBO95292 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAPBO95292 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAPBO95292 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAPBO95292 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAPBO95292 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAPBO95292 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAPBO95292 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
VAPBO95292 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAPBO95292 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAPBO95292 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAPBO95292 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms