Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNKO75909 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNKO75909 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNKO75909 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNKO75909 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNKO75909 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNKO75909 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNKO75909 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNKO75909 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNKO75909 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNKO75909 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNKO75909 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNKO75909 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNKO75909 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNKO75909 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNKO75909 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNKO75909 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNKO75909 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNKO75909 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNKO75909 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNKO75909 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNKO75909 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNKO75909 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNKO75909 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNKO75909 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNKO75909 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNKO75909 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNKO75909 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNKO75909 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNKO75909 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNKO75909 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNKO75909 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNKO75909 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNKO75909 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNKO75909 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNKO75909 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNKO75909 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCNKO75909 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCNKO75909 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCNKO75909 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNKO75909 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNKO75909 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNKO75909 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNKO75909 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNKO75909 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNKO75909 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNKO75909 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNKO75909 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNKO75909 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNKO75909 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNKO75909 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNKO75909 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNKO75909 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNKO75909 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNKO75909 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNKO75909 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNKO75909 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNKO75909 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNKO75909 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNKO75909 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNKO75909 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNKO75909 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNKO75909 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNKO75909 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNKO75909 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNKO75909 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNKO75909 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNKO75909 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNKO75909 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCNKO75909 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNKO75909 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNKO75909 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNKO75909 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNKO75909 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNKO75909 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNKO75909 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNKO75909 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNKO75909 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNKO75909 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNKO75909 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNKO75909 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNKO75909 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNKO75909 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNKO75909 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNKO75909 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNKO75909 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNKO75909 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCNKO75909 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNKO75909 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNKO75909 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNKO75909 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNKO75909 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNKO75909 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNKO75909 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNKO75909 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNKO75909 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNKO75909 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNKO75909 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNKO75909 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCNKO75909 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms