Protein–RNA interactions for Protein: O14965

AURKA, Aurora kinase A, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AURKAO14965 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AURKAO14965 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
AURKAO14965 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AURKAO14965 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AURKAO14965 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AURKAO14965 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AURKAO14965 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AURKAO14965 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AURKAO14965 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AURKAO14965 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AURKAO14965 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AURKAO14965 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AURKAO14965 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AURKAO14965 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AURKAO14965 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AURKAO14965 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AURKAO14965 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AURKAO14965 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AURKAO14965 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AURKAO14965 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AURKAO14965 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
AURKAO14965 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AURKAO14965 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AURKAO14965 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AURKAO14965 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AURKAO14965 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AURKAO14965 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AURKAO14965 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
AURKAO14965 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AURKAO14965 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AURKAO14965 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AURKAO14965 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
AURKAO14965 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AURKAO14965 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AURKAO14965 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AURKAO14965 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AURKAO14965 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AURKAO14965 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AURKAO14965 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AURKAO14965 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AURKAO14965 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AURKAO14965 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AURKAO14965 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AURKAO14965 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AURKAO14965 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AURKAO14965 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AURKAO14965 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AURKAO14965 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AURKAO14965 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AURKAO14965 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AURKAO14965 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AURKAO14965 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AURKAO14965 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AURKAO14965 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AURKAO14965 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AURKAO14965 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AURKAO14965 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AURKAO14965 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AURKAO14965 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AURKAO14965 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AURKAO14965 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AURKAO14965 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AURKAO14965 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AURKAO14965 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AURKAO14965 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AURKAO14965 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AURKAO14965 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AURKAO14965 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AURKAO14965 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AURKAO14965 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AURKAO14965 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AURKAO14965 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AURKAO14965 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AURKAO14965 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AURKAO14965 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AURKAO14965 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AURKAO14965 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AURKAO14965 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AURKAO14965 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AURKAO14965 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
AURKAO14965 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AURKAO14965 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AURKAO14965 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AURKAO14965 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AURKAO14965 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AURKAO14965 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AURKAO14965 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AURKAO14965 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AURKAO14965 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AURKAO14965 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AURKAO14965 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AURKAO14965 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AURKAO14965 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AURKAO14965 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AURKAO14965 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AURKAO14965 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AURKAO14965 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AURKAO14965 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AURKAO14965 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
AURKAO14965 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms