Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms