Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC23IPQ9Y6Y8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC23IPQ9Y6Y8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC23IPQ9Y6Y8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC23IPQ9Y6Y8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC23IPQ9Y6Y8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC23IPQ9Y6Y8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC23IPQ9Y6Y8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC23IPQ9Y6Y8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC23IPQ9Y6Y8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC23IPQ9Y6Y8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC23IPQ9Y6Y8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC23IPQ9Y6Y8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC23IPQ9Y6Y8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC23IPQ9Y6Y8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC23IPQ9Y6Y8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC23IPQ9Y6Y8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC23IPQ9Y6Y8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC23IPQ9Y6Y8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC23IPQ9Y6Y8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC23IPQ9Y6Y8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC23IPQ9Y6Y8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC23IPQ9Y6Y8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC23IPQ9Y6Y8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEC23IPQ9Y6Y8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC23IPQ9Y6Y8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC23IPQ9Y6Y8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEC23IPQ9Y6Y8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC23IPQ9Y6Y8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC23IPQ9Y6Y8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC23IPQ9Y6Y8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC23IPQ9Y6Y8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC23IPQ9Y6Y8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC23IPQ9Y6Y8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC23IPQ9Y6Y8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC23IPQ9Y6Y8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC23IPQ9Y6Y8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC23IPQ9Y6Y8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC23IPQ9Y6Y8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC23IPQ9Y6Y8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SEC23IPQ9Y6Y8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC23IPQ9Y6Y8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC23IPQ9Y6Y8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC23IPQ9Y6Y8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC23IPQ9Y6Y8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC23IPQ9Y6Y8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC23IPQ9Y6Y8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC23IPQ9Y6Y8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC23IPQ9Y6Y8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC23IPQ9Y6Y8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC23IPQ9Y6Y8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC23IPQ9Y6Y8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC23IPQ9Y6Y8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC23IPQ9Y6Y8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC23IPQ9Y6Y8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC23IPQ9Y6Y8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC23IPQ9Y6Y8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC23IPQ9Y6Y8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC23IPQ9Y6Y8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SEC23IPQ9Y6Y8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC23IPQ9Y6Y8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC23IPQ9Y6Y8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC23IPQ9Y6Y8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC23IPQ9Y6Y8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC23IPQ9Y6Y8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC23IPQ9Y6Y8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC23IPQ9Y6Y8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC23IPQ9Y6Y8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC23IPQ9Y6Y8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC23IPQ9Y6Y8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC23IPQ9Y6Y8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC23IPQ9Y6Y8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC23IPQ9Y6Y8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC23IPQ9Y6Y8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC23IPQ9Y6Y8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC23IPQ9Y6Y8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC23IPQ9Y6Y8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC23IPQ9Y6Y8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC23IPQ9Y6Y8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC23IPQ9Y6Y8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC23IPQ9Y6Y8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC23IPQ9Y6Y8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC23IPQ9Y6Y8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC23IPQ9Y6Y8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC23IPQ9Y6Y8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC23IPQ9Y6Y8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC23IPQ9Y6Y8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC23IPQ9Y6Y8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC23IPQ9Y6Y8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC23IPQ9Y6Y8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC23IPQ9Y6Y8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC23IPQ9Y6Y8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC23IPQ9Y6Y8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SEC23IPQ9Y6Y8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms