Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y657

SPIN1, Spindlin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN1Q9Y657 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIN1Q9Y657 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIN1Q9Y657 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIN1Q9Y657 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIN1Q9Y657 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIN1Q9Y657 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIN1Q9Y657 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIN1Q9Y657 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIN1Q9Y657 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIN1Q9Y657 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIN1Q9Y657 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPIN1Q9Y657 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPIN1Q9Y657 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SPIN1Q9Y657 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPIN1Q9Y657 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPIN1Q9Y657 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPIN1Q9Y657 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPIN1Q9Y657 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPIN1Q9Y657 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPIN1Q9Y657 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPIN1Q9Y657 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPIN1Q9Y657 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPIN1Q9Y657 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPIN1Q9Y657 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPIN1Q9Y657 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPIN1Q9Y657 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPIN1Q9Y657 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPIN1Q9Y657 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPIN1Q9Y657 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPIN1Q9Y657 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPIN1Q9Y657 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPIN1Q9Y657 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPIN1Q9Y657 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPIN1Q9Y657 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPIN1Q9Y657 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPIN1Q9Y657 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPIN1Q9Y657 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPIN1Q9Y657 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPIN1Q9Y657 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIN1Q9Y657 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIN1Q9Y657 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPIN1Q9Y657 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPIN1Q9Y657 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPIN1Q9Y657 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPIN1Q9Y657 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPIN1Q9Y657 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIN1Q9Y657 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIN1Q9Y657 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIN1Q9Y657 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIN1Q9Y657 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIN1Q9Y657 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIN1Q9Y657 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIN1Q9Y657 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIN1Q9Y657 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIN1Q9Y657 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIN1Q9Y657 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPIN1Q9Y657 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIN1Q9Y657 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIN1Q9Y657 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIN1Q9Y657 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIN1Q9Y657 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPIN1Q9Y657 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPIN1Q9Y657 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPIN1Q9Y657 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIN1Q9Y657 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIN1Q9Y657 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIN1Q9Y657 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPIN1Q9Y657 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPIN1Q9Y657 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPIN1Q9Y657 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIN1Q9Y657 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIN1Q9Y657 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIN1Q9Y657 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIN1Q9Y657 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPIN1Q9Y657 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPIN1Q9Y657 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPIN1Q9Y657 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPIN1Q9Y657 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPIN1Q9Y657 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPIN1Q9Y657 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIN1Q9Y657 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIN1Q9Y657 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIN1Q9Y657 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIN1Q9Y657 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIN1Q9Y657 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIN1Q9Y657 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIN1Q9Y657 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIN1Q9Y657 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIN1Q9Y657 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIN1Q9Y657 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIN1Q9Y657 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIN1Q9Y657 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIN1Q9Y657 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIN1Q9Y657 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIN1Q9Y657 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIN1Q9Y657 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPIN1Q9Y657 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPIN1Q9Y657 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPIN1Q9Y657 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPIN1Q9Y657 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms