Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y639

NPTN, Neuroplastin, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTNQ9Y639 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPTNQ9Y639 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPTNQ9Y639 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPTNQ9Y639 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPTNQ9Y639 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPTNQ9Y639 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPTNQ9Y639 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPTNQ9Y639 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPTNQ9Y639 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPTNQ9Y639 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPTNQ9Y639 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPTNQ9Y639 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPTNQ9Y639 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPTNQ9Y639 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPTNQ9Y639 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPTNQ9Y639 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPTNQ9Y639 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPTNQ9Y639 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPTNQ9Y639 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPTNQ9Y639 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPTNQ9Y639 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPTNQ9Y639 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPTNQ9Y639 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPTNQ9Y639 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPTNQ9Y639 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPTNQ9Y639 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPTNQ9Y639 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPTNQ9Y639 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPTNQ9Y639 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPTNQ9Y639 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPTNQ9Y639 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPTNQ9Y639 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NPTNQ9Y639 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPTNQ9Y639 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPTNQ9Y639 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPTNQ9Y639 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPTNQ9Y639 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NPTNQ9Y639 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NPTNQ9Y639 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPTNQ9Y639 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPTNQ9Y639 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPTNQ9Y639 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPTNQ9Y639 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NPTNQ9Y639 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPTNQ9Y639 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NPTNQ9Y639 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPTNQ9Y639 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPTNQ9Y639 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPTNQ9Y639 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPTNQ9Y639 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPTNQ9Y639 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPTNQ9Y639 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPTNQ9Y639 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPTNQ9Y639 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPTNQ9Y639 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPTNQ9Y639 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPTNQ9Y639 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NPTNQ9Y639 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPTNQ9Y639 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
NPTNQ9Y639 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPTNQ9Y639 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPTNQ9Y639 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPTNQ9Y639 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPTNQ9Y639 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPTNQ9Y639 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPTNQ9Y639 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPTNQ9Y639 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPTNQ9Y639 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPTNQ9Y639 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPTNQ9Y639 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPTNQ9Y639 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPTNQ9Y639 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPTNQ9Y639 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPTNQ9Y639 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPTNQ9Y639 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPTNQ9Y639 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPTNQ9Y639 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPTNQ9Y639 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPTNQ9Y639 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPTNQ9Y639 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPTNQ9Y639 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPTNQ9Y639 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPTNQ9Y639 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPTNQ9Y639 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NPTNQ9Y639 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NPTNQ9Y639 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPTNQ9Y639 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NPTNQ9Y639 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPTNQ9Y639 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPTNQ9Y639 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPTNQ9Y639 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPTNQ9Y639 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPTNQ9Y639 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPTNQ9Y639 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPTNQ9Y639 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPTNQ9Y639 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPTNQ9Y639 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPTNQ9Y639 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPTNQ9Y639 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NPTNQ9Y639 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms