Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y625

GPC6, Glypican-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6Q9Y625 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC6Q9Y625 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC6Q9Y625 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC6Q9Y625 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC6Q9Y625 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC6Q9Y625 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC6Q9Y625 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC6Q9Y625 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPC6Q9Y625 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPC6Q9Y625 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPC6Q9Y625 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC6Q9Y625 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC6Q9Y625 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC6Q9Y625 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC6Q9Y625 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC6Q9Y625 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC6Q9Y625 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC6Q9Y625 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC6Q9Y625 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC6Q9Y625 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC6Q9Y625 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC6Q9Y625 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC6Q9Y625 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC6Q9Y625 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC6Q9Y625 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC6Q9Y625 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC6Q9Y625 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC6Q9Y625 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC6Q9Y625 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC6Q9Y625 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC6Q9Y625 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC6Q9Y625 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC6Q9Y625 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC6Q9Y625 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC6Q9Y625 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC6Q9Y625 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC6Q9Y625 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC6Q9Y625 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC6Q9Y625 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC6Q9Y625 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC6Q9Y625 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC6Q9Y625 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC6Q9Y625 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC6Q9Y625 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC6Q9Y625 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC6Q9Y625 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC6Q9Y625 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC6Q9Y625 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC6Q9Y625 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC6Q9Y625 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC6Q9Y625 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC6Q9Y625 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC6Q9Y625 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC6Q9Y625 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC6Q9Y625 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC6Q9Y625 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC6Q9Y625 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC6Q9Y625 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC6Q9Y625 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC6Q9Y625 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC6Q9Y625 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC6Q9Y625 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC6Q9Y625 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC6Q9Y625 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC6Q9Y625 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC6Q9Y625 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC6Q9Y625 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC6Q9Y625 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC6Q9Y625 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC6Q9Y625 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC6Q9Y625 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC6Q9Y625 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC6Q9Y625 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC6Q9Y625 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC6Q9Y625 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC6Q9Y625 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC6Q9Y625 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC6Q9Y625 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPC6Q9Y625 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms