Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5S2

CDC42BPB, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42BPBQ9Y5S2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
CDC42BPBQ9Y5S2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
CDC42BPBQ9Y5S2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
CDC42BPBQ9Y5S2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
CDC42BPBQ9Y5S2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
CDC42BPBQ9Y5S2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC41.48■■■■■ 4.23
CDC42BPBQ9Y5S2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
CDC42BPBQ9Y5S2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC41.48■■■■■ 4.23
CDC42BPBQ9Y5S2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
CDC42BPBQ9Y5S2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CDC42BPBQ9Y5S2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
CDC42BPBQ9Y5S2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
CDC42BPBQ9Y5S2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
CDC42BPBQ9Y5S2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
CDC42BPBQ9Y5S2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
CDC42BPBQ9Y5S2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
CDC42BPBQ9Y5S2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
CDC42BPBQ9Y5S2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
CDC42BPBQ9Y5S2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
CDC42BPBQ9Y5S2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CDC42BPBQ9Y5S2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CDC42BPBQ9Y5S2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
CDC42BPBQ9Y5S2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CDC42BPBQ9Y5S2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CDC42BPBQ9Y5S2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
CDC42BPBQ9Y5S2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
CDC42BPBQ9Y5S2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CDC42BPBQ9Y5S2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
CDC42BPBQ9Y5S2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CDC42BPBQ9Y5S2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CDC42BPBQ9Y5S2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC41.31■■■■■ 4.2
CDC42BPBQ9Y5S2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
CDC42BPBQ9Y5S2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
CDC42BPBQ9Y5S2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC41.3■■■■■ 4.2
CDC42BPBQ9Y5S2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CDC42BPBQ9Y5S2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CDC42BPBQ9Y5S2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CDC42BPBQ9Y5S2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CDC42BPBQ9Y5S2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CDC42BPBQ9Y5S2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
CDC42BPBQ9Y5S2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
CDC42BPBQ9Y5S2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
CDC42BPBQ9Y5S2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
CDC42BPBQ9Y5S2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CDC42BPBQ9Y5S2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
CDC42BPBQ9Y5S2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CDC42BPBQ9Y5S2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC41.23■■■■■ 4.19
CDC42BPBQ9Y5S2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CDC42BPBQ9Y5S2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CDC42BPBQ9Y5S2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
CDC42BPBQ9Y5S2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CDC42BPBQ9Y5S2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CDC42BPBQ9Y5S2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
CDC42BPBQ9Y5S2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CDC42BPBQ9Y5S2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
CDC42BPBQ9Y5S2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
CDC42BPBQ9Y5S2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CDC42BPBQ9Y5S2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
CDC42BPBQ9Y5S2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
CDC42BPBQ9Y5S2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CDC42BPBQ9Y5S2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CDC42BPBQ9Y5S2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CDC42BPBQ9Y5S2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
CDC42BPBQ9Y5S2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.18
CDC42BPBQ9Y5S2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
CDC42BPBQ9Y5S2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
CDC42BPBQ9Y5S2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CDC42BPBQ9Y5S2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CDC42BPBQ9Y5S2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CDC42BPBQ9Y5S2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CDC42BPBQ9Y5S2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CDC42BPBQ9Y5S2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CDC42BPBQ9Y5S2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
CDC42BPBQ9Y5S2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CDC42BPBQ9Y5S2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CDC42BPBQ9Y5S2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CDC42BPBQ9Y5S2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CDC42BPBQ9Y5S2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
CDC42BPBQ9Y5S2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
CDC42BPBQ9Y5S2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CDC42BPBQ9Y5S2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
CDC42BPBQ9Y5S2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CDC42BPBQ9Y5S2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CDC42BPBQ9Y5S2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CDC42BPBQ9Y5S2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CDC42BPBQ9Y5S2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CDC42BPBQ9Y5S2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CDC42BPBQ9Y5S2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CDC42BPBQ9Y5S2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CDC42BPBQ9Y5S2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CDC42BPBQ9Y5S2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
CDC42BPBQ9Y5S2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
CDC42BPBQ9Y5S2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CDC42BPBQ9Y5S2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CDC42BPBQ9Y5S2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
CDC42BPBQ9Y5S2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
CDC42BPBQ9Y5S2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CDC42BPBQ9Y5S2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CDC42BPBQ9Y5S2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
CDC42BPBQ9Y5S2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms