Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN16Q9Y5I7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN16Q9Y5I7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN16Q9Y5I7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN16Q9Y5I7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN16Q9Y5I7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN16Q9Y5I7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN16Q9Y5I7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN16Q9Y5I7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN16Q9Y5I7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN16Q9Y5I7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN16Q9Y5I7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN16Q9Y5I7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN16Q9Y5I7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN16Q9Y5I7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN16Q9Y5I7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN16Q9Y5I7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN16Q9Y5I7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN16Q9Y5I7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN16Q9Y5I7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN16Q9Y5I7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN16Q9Y5I7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN16Q9Y5I7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN16Q9Y5I7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN16Q9Y5I7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN16Q9Y5I7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN16Q9Y5I7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN16Q9Y5I7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN16Q9Y5I7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN16Q9Y5I7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN16Q9Y5I7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN16Q9Y5I7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN16Q9Y5I7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN16Q9Y5I7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN16Q9Y5I7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN16Q9Y5I7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN16Q9Y5I7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN16Q9Y5I7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN16Q9Y5I7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN16Q9Y5I7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN16Q9Y5I7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN16Q9Y5I7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN16Q9Y5I7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN16Q9Y5I7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN16Q9Y5I7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN16Q9Y5I7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN16Q9Y5I7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN16Q9Y5I7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN16Q9Y5I7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN16Q9Y5I7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN16Q9Y5I7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN16Q9Y5I7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN16Q9Y5I7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN16Q9Y5I7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN16Q9Y5I7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN16Q9Y5I7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLDN16Q9Y5I7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN16Q9Y5I7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN16Q9Y5I7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN16Q9Y5I7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN16Q9Y5I7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN16Q9Y5I7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN16Q9Y5I7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN16Q9Y5I7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN16Q9Y5I7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN16Q9Y5I7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN16Q9Y5I7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN16Q9Y5I7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN16Q9Y5I7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN16Q9Y5I7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN16Q9Y5I7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN16Q9Y5I7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN16Q9Y5I7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN16Q9Y5I7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN16Q9Y5I7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN16Q9Y5I7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN16Q9Y5I7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN16Q9Y5I7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN16Q9Y5I7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN16Q9Y5I7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN16Q9Y5I7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN16Q9Y5I7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN16Q9Y5I7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN16Q9Y5I7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN16Q9Y5I7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN16Q9Y5I7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN16Q9Y5I7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN16Q9Y5I7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN16Q9Y5I7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN16Q9Y5I7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN16Q9Y5I7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN16Q9Y5I7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN16Q9Y5I7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN16Q9Y5I7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN16Q9Y5I7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN16Q9Y5I7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN16Q9Y5I7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN16Q9Y5I7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN16Q9Y5I7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN16Q9Y5I7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms