Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y512

SAMM50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMM50Q9Y512 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SAMM50Q9Y512 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SAMM50Q9Y512 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SAMM50Q9Y512 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SAMM50Q9Y512 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SAMM50Q9Y512 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SAMM50Q9Y512 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SAMM50Q9Y512 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SAMM50Q9Y512 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SAMM50Q9Y512 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SAMM50Q9Y512 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SAMM50Q9Y512 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SAMM50Q9Y512 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SAMM50Q9Y512 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SAMM50Q9Y512 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SAMM50Q9Y512 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SAMM50Q9Y512 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SAMM50Q9Y512 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SAMM50Q9Y512 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SAMM50Q9Y512 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SAMM50Q9Y512 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SAMM50Q9Y512 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SAMM50Q9Y512 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SAMM50Q9Y512 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SAMM50Q9Y512 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SAMM50Q9Y512 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SAMM50Q9Y512 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SAMM50Q9Y512 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SAMM50Q9Y512 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SAMM50Q9Y512 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SAMM50Q9Y512 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SAMM50Q9Y512 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SAMM50Q9Y512 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SAMM50Q9Y512 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SAMM50Q9Y512 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SAMM50Q9Y512 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SAMM50Q9Y512 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SAMM50Q9Y512 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SAMM50Q9Y512 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SAMM50Q9Y512 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SAMM50Q9Y512 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SAMM50Q9Y512 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SAMM50Q9Y512 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SAMM50Q9Y512 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SAMM50Q9Y512 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SAMM50Q9Y512 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SAMM50Q9Y512 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SAMM50Q9Y512 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SAMM50Q9Y512 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SAMM50Q9Y512 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SAMM50Q9Y512 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SAMM50Q9Y512 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SAMM50Q9Y512 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SAMM50Q9Y512 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SAMM50Q9Y512 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SAMM50Q9Y512 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SAMM50Q9Y512 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SAMM50Q9Y512 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SAMM50Q9Y512 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SAMM50Q9Y512 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SAMM50Q9Y512 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SAMM50Q9Y512 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SAMM50Q9Y512 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SAMM50Q9Y512 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SAMM50Q9Y512 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SAMM50Q9Y512 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SAMM50Q9Y512 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SAMM50Q9Y512 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SAMM50Q9Y512 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SAMM50Q9Y512 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SAMM50Q9Y512 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SAMM50Q9Y512 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SAMM50Q9Y512 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SAMM50Q9Y512 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SAMM50Q9Y512 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SAMM50Q9Y512 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SAMM50Q9Y512 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SAMM50Q9Y512 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SAMM50Q9Y512 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SAMM50Q9Y512 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SAMM50Q9Y512 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SAMM50Q9Y512 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SAMM50Q9Y512 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SAMM50Q9Y512 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SAMM50Q9Y512 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SAMM50Q9Y512 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SAMM50Q9Y512 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SAMM50Q9Y512 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SAMM50Q9Y512 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMM50Q9Y512 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SAMM50Q9Y512 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SAMM50Q9Y512 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SAMM50Q9Y512 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SAMM50Q9Y512 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMM50Q9Y512 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SAMM50Q9Y512 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SAMM50Q9Y512 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SAMM50Q9Y512 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SAMM50Q9Y512 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SAMM50Q9Y512 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms