Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2B5

VPS9D1, VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1Q9Y2B5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS9D1Q9Y2B5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS9D1Q9Y2B5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS9D1Q9Y2B5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS9D1Q9Y2B5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS9D1Q9Y2B5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS9D1Q9Y2B5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS9D1Q9Y2B5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS9D1Q9Y2B5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS9D1Q9Y2B5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS9D1Q9Y2B5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS9D1Q9Y2B5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS9D1Q9Y2B5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS9D1Q9Y2B5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS9D1Q9Y2B5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS9D1Q9Y2B5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS9D1Q9Y2B5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS9D1Q9Y2B5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VPS9D1Q9Y2B5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS9D1Q9Y2B5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS9D1Q9Y2B5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS9D1Q9Y2B5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS9D1Q9Y2B5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS9D1Q9Y2B5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS9D1Q9Y2B5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS9D1Q9Y2B5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS9D1Q9Y2B5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS9D1Q9Y2B5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS9D1Q9Y2B5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS9D1Q9Y2B5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS9D1Q9Y2B5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS9D1Q9Y2B5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS9D1Q9Y2B5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS9D1Q9Y2B5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS9D1Q9Y2B5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS9D1Q9Y2B5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS9D1Q9Y2B5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS9D1Q9Y2B5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS9D1Q9Y2B5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS9D1Q9Y2B5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS9D1Q9Y2B5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS9D1Q9Y2B5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS9D1Q9Y2B5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS9D1Q9Y2B5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS9D1Q9Y2B5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS9D1Q9Y2B5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS9D1Q9Y2B5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS9D1Q9Y2B5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS9D1Q9Y2B5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS9D1Q9Y2B5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS9D1Q9Y2B5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS9D1Q9Y2B5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS9D1Q9Y2B5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS9D1Q9Y2B5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS9D1Q9Y2B5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS9D1Q9Y2B5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS9D1Q9Y2B5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS9D1Q9Y2B5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS9D1Q9Y2B5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS9D1Q9Y2B5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS9D1Q9Y2B5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS9D1Q9Y2B5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS9D1Q9Y2B5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS9D1Q9Y2B5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS9D1Q9Y2B5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS9D1Q9Y2B5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS9D1Q9Y2B5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VPS9D1Q9Y2B5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VPS9D1Q9Y2B5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VPS9D1Q9Y2B5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VPS9D1Q9Y2B5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VPS9D1Q9Y2B5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS9D1Q9Y2B5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS9D1Q9Y2B5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS9D1Q9Y2B5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS9D1Q9Y2B5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS9D1Q9Y2B5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS9D1Q9Y2B5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS9D1Q9Y2B5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS9D1Q9Y2B5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS9D1Q9Y2B5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS9D1Q9Y2B5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS9D1Q9Y2B5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS9D1Q9Y2B5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS9D1Q9Y2B5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS9D1Q9Y2B5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS9D1Q9Y2B5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS9D1Q9Y2B5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS9D1Q9Y2B5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS9D1Q9Y2B5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS9D1Q9Y2B5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS9D1Q9Y2B5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS9D1Q9Y2B5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS9D1Q9Y2B5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS9D1Q9Y2B5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS9D1Q9Y2B5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS9D1Q9Y2B5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS9D1Q9Y2B5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms