Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y262

EIF3L, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3LQ9Y262 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EIF3LQ9Y262 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EIF3LQ9Y262 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EIF3LQ9Y262 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EIF3LQ9Y262 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EIF3LQ9Y262 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EIF3LQ9Y262 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3LQ9Y262 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3LQ9Y262 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3LQ9Y262 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3LQ9Y262 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EIF3LQ9Y262 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF3LQ9Y262 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF3LQ9Y262 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF3LQ9Y262 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF3LQ9Y262 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EIF3LQ9Y262 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF3LQ9Y262 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF3LQ9Y262 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF3LQ9Y262 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EIF3LQ9Y262 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF3LQ9Y262 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF3LQ9Y262 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF3LQ9Y262 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF3LQ9Y262 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF3LQ9Y262 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF3LQ9Y262 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF3LQ9Y262 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF3LQ9Y262 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3LQ9Y262 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3LQ9Y262 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3LQ9Y262 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3LQ9Y262 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3LQ9Y262 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3LQ9Y262 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3LQ9Y262 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3LQ9Y262 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3LQ9Y262 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3LQ9Y262 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3LQ9Y262 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3LQ9Y262 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3LQ9Y262 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3LQ9Y262 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3LQ9Y262 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3LQ9Y262 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF3LQ9Y262 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF3LQ9Y262 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF3LQ9Y262 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF3LQ9Y262 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF3LQ9Y262 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF3LQ9Y262 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EIF3LQ9Y262 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF3LQ9Y262 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF3LQ9Y262 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF3LQ9Y262 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF3LQ9Y262 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF3LQ9Y262 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF3LQ9Y262 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF3LQ9Y262 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF3LQ9Y262 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF3LQ9Y262 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF3LQ9Y262 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF3LQ9Y262 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF3LQ9Y262 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF3LQ9Y262 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF3LQ9Y262 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF3LQ9Y262 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF3LQ9Y262 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3LQ9Y262 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3LQ9Y262 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3LQ9Y262 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3LQ9Y262 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3LQ9Y262 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3LQ9Y262 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3LQ9Y262 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3LQ9Y262 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3LQ9Y262 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3LQ9Y262 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF3LQ9Y262 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF3LQ9Y262 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF3LQ9Y262 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF3LQ9Y262 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3LQ9Y262 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF3LQ9Y262 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3LQ9Y262 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3LQ9Y262 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3LQ9Y262 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3LQ9Y262 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3LQ9Y262 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3LQ9Y262 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3LQ9Y262 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3LQ9Y262 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3LQ9Y262 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3LQ9Y262 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3LQ9Y262 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3LQ9Y262 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3LQ9Y262 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EIF3LQ9Y262 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EIF3LQ9Y262 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF3LQ9Y262 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms