Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHKBQ9Y259 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHKBQ9Y259 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHKBQ9Y259 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHKBQ9Y259 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHKBQ9Y259 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHKBQ9Y259 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHKBQ9Y259 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHKBQ9Y259 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHKBQ9Y259 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHKBQ9Y259 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHKBQ9Y259 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHKBQ9Y259 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHKBQ9Y259 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CHKBQ9Y259 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHKBQ9Y259 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHKBQ9Y259 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHKBQ9Y259 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHKBQ9Y259 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHKBQ9Y259 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHKBQ9Y259 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHKBQ9Y259 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHKBQ9Y259 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CHKBQ9Y259 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHKBQ9Y259 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHKBQ9Y259 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHKBQ9Y259 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHKBQ9Y259 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHKBQ9Y259 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHKBQ9Y259 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHKBQ9Y259 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHKBQ9Y259 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHKBQ9Y259 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CHKBQ9Y259 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHKBQ9Y259 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHKBQ9Y259 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHKBQ9Y259 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHKBQ9Y259 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHKBQ9Y259 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHKBQ9Y259 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHKBQ9Y259 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHKBQ9Y259 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHKBQ9Y259 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHKBQ9Y259 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHKBQ9Y259 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHKBQ9Y259 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHKBQ9Y259 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHKBQ9Y259 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHKBQ9Y259 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHKBQ9Y259 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHKBQ9Y259 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHKBQ9Y259 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHKBQ9Y259 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHKBQ9Y259 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHKBQ9Y259 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHKBQ9Y259 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHKBQ9Y259 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHKBQ9Y259 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHKBQ9Y259 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHKBQ9Y259 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHKBQ9Y259 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHKBQ9Y259 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHKBQ9Y259 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHKBQ9Y259 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHKBQ9Y259 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHKBQ9Y259 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHKBQ9Y259 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHKBQ9Y259 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHKBQ9Y259 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHKBQ9Y259 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHKBQ9Y259 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHKBQ9Y259 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHKBQ9Y259 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHKBQ9Y259 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHKBQ9Y259 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHKBQ9Y259 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHKBQ9Y259 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHKBQ9Y259 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHKBQ9Y259 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHKBQ9Y259 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHKBQ9Y259 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHKBQ9Y259 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CHKBQ9Y259 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHKBQ9Y259 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHKBQ9Y259 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHKBQ9Y259 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHKBQ9Y259 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHKBQ9Y259 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHKBQ9Y259 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CHKBQ9Y259 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHKBQ9Y259 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHKBQ9Y259 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHKBQ9Y259 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHKBQ9Y259 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHKBQ9Y259 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHKBQ9Y259 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHKBQ9Y259 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHKBQ9Y259 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHKBQ9Y259 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHKBQ9Y259 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms