Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ35

SRRM2, Serine/arginine repetitive matrix protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM2Q9UQ35 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRM2Q9UQ35 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRRM2Q9UQ35 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRM2Q9UQ35 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRRM2Q9UQ35 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRM2Q9UQ35 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRM2Q9UQ35 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRM2Q9UQ35 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRRM2Q9UQ35 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRM2Q9UQ35 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRRM2Q9UQ35 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRM2Q9UQ35 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRM2Q9UQ35 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRM2Q9UQ35 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRM2Q9UQ35 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRRM2Q9UQ35 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SRRM2Q9UQ35 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SRRM2Q9UQ35 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SRRM2Q9UQ35 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRM2Q9UQ35 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRM2Q9UQ35 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRM2Q9UQ35 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRM2Q9UQ35 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRM2Q9UQ35 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRRM2Q9UQ35 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRM2Q9UQ35 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRM2Q9UQ35 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRM2Q9UQ35 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM2Q9UQ35 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM2Q9UQ35 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRM2Q9UQ35 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRM2Q9UQ35 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRM2Q9UQ35 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRM2Q9UQ35 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRM2Q9UQ35 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRM2Q9UQ35 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM2Q9UQ35 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM2Q9UQ35 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM2Q9UQ35 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM2Q9UQ35 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM2Q9UQ35 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM2Q9UQ35 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM2Q9UQ35 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM2Q9UQ35 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM2Q9UQ35 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SRRM2Q9UQ35 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM2Q9UQ35 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM2Q9UQ35 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM2Q9UQ35 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM2Q9UQ35 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM2Q9UQ35 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM2Q9UQ35 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM2Q9UQ35 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM2Q9UQ35 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM2Q9UQ35 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM2Q9UQ35 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM2Q9UQ35 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM2Q9UQ35 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM2Q9UQ35 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM2Q9UQ35 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM2Q9UQ35 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM2Q9UQ35 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM2Q9UQ35 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM2Q9UQ35 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM2Q9UQ35 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM2Q9UQ35 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM2Q9UQ35 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM2Q9UQ35 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM2Q9UQ35 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM2Q9UQ35 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM2Q9UQ35 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM2Q9UQ35 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRRM2Q9UQ35 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRRM2Q9UQ35 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRRM2Q9UQ35 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRRM2Q9UQ35 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRRM2Q9UQ35 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRRM2Q9UQ35 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRRM2Q9UQ35 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRRM2Q9UQ35 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRRM2Q9UQ35 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRRM2Q9UQ35 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRRM2Q9UQ35 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRM2Q9UQ35 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRM2Q9UQ35 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRM2Q9UQ35 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRM2Q9UQ35 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRM2Q9UQ35 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRM2Q9UQ35 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRM2Q9UQ35 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRM2Q9UQ35 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRM2Q9UQ35 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRM2Q9UQ35 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRM2Q9UQ35 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM2Q9UQ35 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM2Q9UQ35 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM2Q9UQ35 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM2Q9UQ35 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM2Q9UQ35 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM2Q9UQ35 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms