Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC12A4Q9UP95 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC12A4Q9UP95 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC12A4Q9UP95 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC12A4Q9UP95 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC12A4Q9UP95 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC12A4Q9UP95 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC12A4Q9UP95 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC12A4Q9UP95 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC12A4Q9UP95 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC12A4Q9UP95 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC12A4Q9UP95 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC12A4Q9UP95 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC12A4Q9UP95 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC12A4Q9UP95 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC12A4Q9UP95 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC12A4Q9UP95 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC12A4Q9UP95 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC12A4Q9UP95 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC12A4Q9UP95 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC12A4Q9UP95 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC12A4Q9UP95 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC12A4Q9UP95 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC12A4Q9UP95 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC12A4Q9UP95 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC12A4Q9UP95 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC12A4Q9UP95 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC12A4Q9UP95 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC12A4Q9UP95 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC12A4Q9UP95 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC12A4Q9UP95 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC12A4Q9UP95 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC12A4Q9UP95 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC12A4Q9UP95 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC12A4Q9UP95 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC12A4Q9UP95 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC12A4Q9UP95 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC12A4Q9UP95 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC12A4Q9UP95 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC12A4Q9UP95 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC12A4Q9UP95 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC12A4Q9UP95 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC12A4Q9UP95 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC12A4Q9UP95 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC12A4Q9UP95 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC12A4Q9UP95 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC12A4Q9UP95 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC12A4Q9UP95 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC12A4Q9UP95 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC12A4Q9UP95 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC12A4Q9UP95 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC12A4Q9UP95 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC12A4Q9UP95 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC12A4Q9UP95 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC12A4Q9UP95 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC12A4Q9UP95 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC12A4Q9UP95 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC12A4Q9UP95 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC12A4Q9UP95 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC12A4Q9UP95 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC12A4Q9UP95 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC12A4Q9UP95 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC12A4Q9UP95 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC12A4Q9UP95 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC12A4Q9UP95 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC12A4Q9UP95 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC12A4Q9UP95 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC12A4Q9UP95 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC12A4Q9UP95 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC12A4Q9UP95 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC12A4Q9UP95 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC12A4Q9UP95 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC12A4Q9UP95 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC12A4Q9UP95 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC12A4Q9UP95 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC12A4Q9UP95 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC12A4Q9UP95 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC12A4Q9UP95 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC12A4Q9UP95 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC12A4Q9UP95 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC12A4Q9UP95 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC12A4Q9UP95 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC12A4Q9UP95 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC12A4Q9UP95 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC12A4Q9UP95 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC12A4Q9UP95 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC12A4Q9UP95 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC12A4Q9UP95 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC12A4Q9UP95 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC12A4Q9UP95 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC12A4Q9UP95 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC12A4Q9UP95 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC12A4Q9UP95 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC12A4Q9UP95 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC12A4Q9UP95 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC12A4Q9UP95 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC12A4Q9UP95 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC12A4Q9UP95 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC12A4Q9UP95 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC12A4Q9UP95 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms