Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP65

PLA2G4C, Cytosolic phospholipase A2 gamma, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4CQ9UP65 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PLA2G4CQ9UP65 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLA2G4CQ9UP65 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLA2G4CQ9UP65 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLA2G4CQ9UP65 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLA2G4CQ9UP65 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLA2G4CQ9UP65 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLA2G4CQ9UP65 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLA2G4CQ9UP65 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLA2G4CQ9UP65 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLA2G4CQ9UP65 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLA2G4CQ9UP65 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLA2G4CQ9UP65 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLA2G4CQ9UP65 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLA2G4CQ9UP65 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLA2G4CQ9UP65 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLA2G4CQ9UP65 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLA2G4CQ9UP65 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLA2G4CQ9UP65 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLA2G4CQ9UP65 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLA2G4CQ9UP65 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLA2G4CQ9UP65 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLA2G4CQ9UP65 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLA2G4CQ9UP65 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLA2G4CQ9UP65 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLA2G4CQ9UP65 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLA2G4CQ9UP65 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PLA2G4CQ9UP65 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLA2G4CQ9UP65 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLA2G4CQ9UP65 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLA2G4CQ9UP65 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLA2G4CQ9UP65 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLA2G4CQ9UP65 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLA2G4CQ9UP65 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLA2G4CQ9UP65 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLA2G4CQ9UP65 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PLA2G4CQ9UP65 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLA2G4CQ9UP65 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLA2G4CQ9UP65 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLA2G4CQ9UP65 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLA2G4CQ9UP65 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLA2G4CQ9UP65 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLA2G4CQ9UP65 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLA2G4CQ9UP65 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLA2G4CQ9UP65 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLA2G4CQ9UP65 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLA2G4CQ9UP65 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLA2G4CQ9UP65 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLA2G4CQ9UP65 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLA2G4CQ9UP65 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLA2G4CQ9UP65 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLA2G4CQ9UP65 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLA2G4CQ9UP65 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLA2G4CQ9UP65 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLA2G4CQ9UP65 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLA2G4CQ9UP65 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLA2G4CQ9UP65 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLA2G4CQ9UP65 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLA2G4CQ9UP65 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PLA2G4CQ9UP65 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLA2G4CQ9UP65 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLA2G4CQ9UP65 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLA2G4CQ9UP65 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLA2G4CQ9UP65 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLA2G4CQ9UP65 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLA2G4CQ9UP65 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLA2G4CQ9UP65 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLA2G4CQ9UP65 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLA2G4CQ9UP65 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PLA2G4CQ9UP65 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLA2G4CQ9UP65 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLA2G4CQ9UP65 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLA2G4CQ9UP65 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLA2G4CQ9UP65 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLA2G4CQ9UP65 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLA2G4CQ9UP65 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLA2G4CQ9UP65 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLA2G4CQ9UP65 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLA2G4CQ9UP65 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLA2G4CQ9UP65 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLA2G4CQ9UP65 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PLA2G4CQ9UP65 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PLA2G4CQ9UP65 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLA2G4CQ9UP65 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PLA2G4CQ9UP65 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLA2G4CQ9UP65 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLA2G4CQ9UP65 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLA2G4CQ9UP65 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLA2G4CQ9UP65 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLA2G4CQ9UP65 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLA2G4CQ9UP65 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLA2G4CQ9UP65 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLA2G4CQ9UP65 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PLA2G4CQ9UP65 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLA2G4CQ9UP65 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLA2G4CQ9UP65 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLA2G4CQ9UP65 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLA2G4CQ9UP65 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLA2G4CQ9UP65 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLA2G4CQ9UP65 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.6 ms