Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK23

NAGPA, N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGPAQ9UK23 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NAGPAQ9UK23 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NAGPAQ9UK23 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NAGPAQ9UK23 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NAGPAQ9UK23 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NAGPAQ9UK23 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NAGPAQ9UK23 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NAGPAQ9UK23 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NAGPAQ9UK23 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NAGPAQ9UK23 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NAGPAQ9UK23 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NAGPAQ9UK23 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NAGPAQ9UK23 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NAGPAQ9UK23 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NAGPAQ9UK23 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NAGPAQ9UK23 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NAGPAQ9UK23 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NAGPAQ9UK23 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NAGPAQ9UK23 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NAGPAQ9UK23 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NAGPAQ9UK23 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NAGPAQ9UK23 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NAGPAQ9UK23 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NAGPAQ9UK23 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NAGPAQ9UK23 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NAGPAQ9UK23 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NAGPAQ9UK23 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NAGPAQ9UK23 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NAGPAQ9UK23 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NAGPAQ9UK23 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NAGPAQ9UK23 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NAGPAQ9UK23 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NAGPAQ9UK23 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NAGPAQ9UK23 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NAGPAQ9UK23 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NAGPAQ9UK23 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NAGPAQ9UK23 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NAGPAQ9UK23 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NAGPAQ9UK23 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NAGPAQ9UK23 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NAGPAQ9UK23 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NAGPAQ9UK23 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NAGPAQ9UK23 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NAGPAQ9UK23 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NAGPAQ9UK23 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NAGPAQ9UK23 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NAGPAQ9UK23 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NAGPAQ9UK23 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NAGPAQ9UK23 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NAGPAQ9UK23 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NAGPAQ9UK23 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NAGPAQ9UK23 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NAGPAQ9UK23 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NAGPAQ9UK23 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NAGPAQ9UK23 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NAGPAQ9UK23 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NAGPAQ9UK23 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NAGPAQ9UK23 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NAGPAQ9UK23 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NAGPAQ9UK23 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NAGPAQ9UK23 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NAGPAQ9UK23 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
NAGPAQ9UK23 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NAGPAQ9UK23 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NAGPAQ9UK23 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NAGPAQ9UK23 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NAGPAQ9UK23 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NAGPAQ9UK23 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NAGPAQ9UK23 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NAGPAQ9UK23 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NAGPAQ9UK23 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NAGPAQ9UK23 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NAGPAQ9UK23 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NAGPAQ9UK23 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NAGPAQ9UK23 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NAGPAQ9UK23 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NAGPAQ9UK23 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NAGPAQ9UK23 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NAGPAQ9UK23 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NAGPAQ9UK23 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NAGPAQ9UK23 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NAGPAQ9UK23 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NAGPAQ9UK23 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NAGPAQ9UK23 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NAGPAQ9UK23 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NAGPAQ9UK23 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NAGPAQ9UK23 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NAGPAQ9UK23 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NAGPAQ9UK23 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NAGPAQ9UK23 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NAGPAQ9UK23 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NAGPAQ9UK23 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NAGPAQ9UK23 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NAGPAQ9UK23 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NAGPAQ9UK23 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NAGPAQ9UK23 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NAGPAQ9UK23 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NAGPAQ9UK23 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NAGPAQ9UK23 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NAGPAQ9UK23 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms