Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA3

MCM8, DNA helicase MCM8, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM8Q9UJA3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCM8Q9UJA3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCM8Q9UJA3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCM8Q9UJA3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MCM8Q9UJA3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCM8Q9UJA3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCM8Q9UJA3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCM8Q9UJA3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCM8Q9UJA3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCM8Q9UJA3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCM8Q9UJA3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCM8Q9UJA3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCM8Q9UJA3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCM8Q9UJA3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCM8Q9UJA3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCM8Q9UJA3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MCM8Q9UJA3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCM8Q9UJA3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCM8Q9UJA3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCM8Q9UJA3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCM8Q9UJA3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCM8Q9UJA3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCM8Q9UJA3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCM8Q9UJA3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCM8Q9UJA3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCM8Q9UJA3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCM8Q9UJA3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCM8Q9UJA3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCM8Q9UJA3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCM8Q9UJA3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCM8Q9UJA3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCM8Q9UJA3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCM8Q9UJA3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCM8Q9UJA3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCM8Q9UJA3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM8Q9UJA3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM8Q9UJA3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCM8Q9UJA3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCM8Q9UJA3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCM8Q9UJA3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM8Q9UJA3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM8Q9UJA3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM8Q9UJA3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM8Q9UJA3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM8Q9UJA3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM8Q9UJA3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM8Q9UJA3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM8Q9UJA3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM8Q9UJA3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM8Q9UJA3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM8Q9UJA3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM8Q9UJA3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM8Q9UJA3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM8Q9UJA3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM8Q9UJA3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM8Q9UJA3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM8Q9UJA3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM8Q9UJA3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM8Q9UJA3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM8Q9UJA3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM8Q9UJA3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM8Q9UJA3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM8Q9UJA3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM8Q9UJA3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM8Q9UJA3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM8Q9UJA3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM8Q9UJA3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM8Q9UJA3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM8Q9UJA3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM8Q9UJA3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM8Q9UJA3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM8Q9UJA3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM8Q9UJA3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM8Q9UJA3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM8Q9UJA3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM8Q9UJA3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM8Q9UJA3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM8Q9UJA3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCM8Q9UJA3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCM8Q9UJA3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCM8Q9UJA3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCM8Q9UJA3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCM8Q9UJA3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCM8Q9UJA3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCM8Q9UJA3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MCM8Q9UJA3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCM8Q9UJA3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCM8Q9UJA3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCM8Q9UJA3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCM8Q9UJA3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCM8Q9UJA3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCM8Q9UJA3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCM8Q9UJA3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCM8Q9UJA3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCM8Q9UJA3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCM8Q9UJA3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCM8Q9UJA3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCM8Q9UJA3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCM8Q9UJA3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM8Q9UJA3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms