Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATPIF1Q9UII2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATPIF1Q9UII2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATPIF1Q9UII2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATPIF1Q9UII2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATPIF1Q9UII2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATPIF1Q9UII2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATPIF1Q9UII2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATPIF1Q9UII2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATPIF1Q9UII2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATPIF1Q9UII2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATPIF1Q9UII2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATPIF1Q9UII2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATPIF1Q9UII2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATPIF1Q9UII2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATPIF1Q9UII2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATPIF1Q9UII2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATPIF1Q9UII2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATPIF1Q9UII2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATPIF1Q9UII2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATPIF1Q9UII2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATPIF1Q9UII2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATPIF1Q9UII2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATPIF1Q9UII2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATPIF1Q9UII2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATPIF1Q9UII2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATPIF1Q9UII2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATPIF1Q9UII2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATPIF1Q9UII2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATPIF1Q9UII2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATPIF1Q9UII2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATPIF1Q9UII2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATPIF1Q9UII2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATPIF1Q9UII2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATPIF1Q9UII2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATPIF1Q9UII2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATPIF1Q9UII2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATPIF1Q9UII2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATPIF1Q9UII2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATPIF1Q9UII2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATPIF1Q9UII2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATPIF1Q9UII2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATPIF1Q9UII2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATPIF1Q9UII2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATPIF1Q9UII2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATPIF1Q9UII2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATPIF1Q9UII2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATPIF1Q9UII2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATPIF1Q9UII2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATPIF1Q9UII2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATPIF1Q9UII2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATPIF1Q9UII2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATPIF1Q9UII2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATPIF1Q9UII2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATPIF1Q9UII2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATPIF1Q9UII2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATPIF1Q9UII2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATPIF1Q9UII2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATPIF1Q9UII2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATPIF1Q9UII2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATPIF1Q9UII2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATPIF1Q9UII2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATPIF1Q9UII2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATPIF1Q9UII2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATPIF1Q9UII2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATPIF1Q9UII2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATPIF1Q9UII2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATPIF1Q9UII2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATPIF1Q9UII2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATPIF1Q9UII2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATPIF1Q9UII2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATPIF1Q9UII2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATPIF1Q9UII2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATPIF1Q9UII2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATPIF1Q9UII2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATPIF1Q9UII2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATPIF1Q9UII2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATPIF1Q9UII2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATPIF1Q9UII2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATPIF1Q9UII2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATPIF1Q9UII2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATPIF1Q9UII2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATPIF1Q9UII2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATPIF1Q9UII2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATPIF1Q9UII2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATPIF1Q9UII2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATPIF1Q9UII2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATPIF1Q9UII2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATPIF1Q9UII2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATPIF1Q9UII2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATPIF1Q9UII2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATPIF1Q9UII2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATPIF1Q9UII2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATPIF1Q9UII2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATPIF1Q9UII2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATPIF1Q9UII2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATPIF1Q9UII2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATPIF1Q9UII2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATPIF1Q9UII2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATPIF1Q9UII2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms