Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DKK2Q9UBU2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DKK2Q9UBU2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DKK2Q9UBU2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DKK2Q9UBU2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DKK2Q9UBU2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DKK2Q9UBU2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DKK2Q9UBU2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DKK2Q9UBU2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DKK2Q9UBU2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK2Q9UBU2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK2Q9UBU2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DKK2Q9UBU2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK2Q9UBU2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK2Q9UBU2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK2Q9UBU2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK2Q9UBU2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK2Q9UBU2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK2Q9UBU2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DKK2Q9UBU2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DKK2Q9UBU2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DKK2Q9UBU2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DKK2Q9UBU2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DKK2Q9UBU2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DKK2Q9UBU2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DKK2Q9UBU2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DKK2Q9UBU2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DKK2Q9UBU2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DKK2Q9UBU2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DKK2Q9UBU2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DKK2Q9UBU2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DKK2Q9UBU2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DKK2Q9UBU2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DKK2Q9UBU2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DKK2Q9UBU2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DKK2Q9UBU2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DKK2Q9UBU2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DKK2Q9UBU2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DKK2Q9UBU2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DKK2Q9UBU2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DKK2Q9UBU2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DKK2Q9UBU2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DKK2Q9UBU2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DKK2Q9UBU2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DKK2Q9UBU2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DKK2Q9UBU2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DKK2Q9UBU2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DKK2Q9UBU2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DKK2Q9UBU2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DKK2Q9UBU2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
DKK2Q9UBU2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DKK2Q9UBU2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DKK2Q9UBU2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DKK2Q9UBU2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DKK2Q9UBU2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DKK2Q9UBU2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DKK2Q9UBU2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
DKK2Q9UBU2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DKK2Q9UBU2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DKK2Q9UBU2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DKK2Q9UBU2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DKK2Q9UBU2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DKK2Q9UBU2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DKK2Q9UBU2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DKK2Q9UBU2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DKK2Q9UBU2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DKK2Q9UBU2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DKK2Q9UBU2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DKK2Q9UBU2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DKK2Q9UBU2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DKK2Q9UBU2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DKK2Q9UBU2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DKK2Q9UBU2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DKK2Q9UBU2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DKK2Q9UBU2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DKK2Q9UBU2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DKK2Q9UBU2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DKK2Q9UBU2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DKK2Q9UBU2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DKK2Q9UBU2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DKK2Q9UBU2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DKK2Q9UBU2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DKK2Q9UBU2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DKK2Q9UBU2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DKK2Q9UBU2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DKK2Q9UBU2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DKK2Q9UBU2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DKK2Q9UBU2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DKK2Q9UBU2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DKK2Q9UBU2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DKK2Q9UBU2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DKK2Q9UBU2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DKK2Q9UBU2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DKK2Q9UBU2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DKK2Q9UBU2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DKK2Q9UBU2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DKK2Q9UBU2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DKK2Q9UBU2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DKK2Q9UBU2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DKK2Q9UBU2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms