Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL9Q9P2J3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL9Q9P2J3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL9Q9P2J3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL9Q9P2J3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL9Q9P2J3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL9Q9P2J3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL9Q9P2J3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL9Q9P2J3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL9Q9P2J3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL9Q9P2J3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL9Q9P2J3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL9Q9P2J3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL9Q9P2J3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL9Q9P2J3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL9Q9P2J3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL9Q9P2J3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL9Q9P2J3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL9Q9P2J3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL9Q9P2J3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KLHL9Q9P2J3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL9Q9P2J3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL9Q9P2J3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL9Q9P2J3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL9Q9P2J3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL9Q9P2J3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL9Q9P2J3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL9Q9P2J3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL9Q9P2J3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL9Q9P2J3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL9Q9P2J3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL9Q9P2J3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL9Q9P2J3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL9Q9P2J3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL9Q9P2J3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL9Q9P2J3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL9Q9P2J3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL9Q9P2J3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL9Q9P2J3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL9Q9P2J3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL9Q9P2J3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL9Q9P2J3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL9Q9P2J3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL9Q9P2J3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL9Q9P2J3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL9Q9P2J3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL9Q9P2J3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL9Q9P2J3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL9Q9P2J3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL9Q9P2J3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL9Q9P2J3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL9Q9P2J3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL9Q9P2J3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL9Q9P2J3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL9Q9P2J3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL9Q9P2J3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL9Q9P2J3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHL9Q9P2J3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL9Q9P2J3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL9Q9P2J3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL9Q9P2J3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL9Q9P2J3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL9Q9P2J3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL9Q9P2J3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL9Q9P2J3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL9Q9P2J3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL9Q9P2J3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL9Q9P2J3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL9Q9P2J3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL9Q9P2J3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL9Q9P2J3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL9Q9P2J3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL9Q9P2J3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL9Q9P2J3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL9Q9P2J3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL9Q9P2J3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL9Q9P2J3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL9Q9P2J3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL9Q9P2J3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL9Q9P2J3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL9Q9P2J3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL9Q9P2J3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL9Q9P2J3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms