Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
RRBP1Q9P2E9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
RRBP1Q9P2E9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
RRBP1Q9P2E9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
RRBP1Q9P2E9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
RRBP1Q9P2E9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
RRBP1Q9P2E9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
RRBP1Q9P2E9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
RRBP1Q9P2E9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
RRBP1Q9P2E9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
RRBP1Q9P2E9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
RRBP1Q9P2E9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
RRBP1Q9P2E9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
RRBP1Q9P2E9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
RRBP1Q9P2E9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.13
RRBP1Q9P2E9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.13
RRBP1Q9P2E9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
RRBP1Q9P2E9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
RRBP1Q9P2E9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
RRBP1Q9P2E9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
RRBP1Q9P2E9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
RRBP1Q9P2E9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC40.77■■■■■ 4.12
RRBP1Q9P2E9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
RRBP1Q9P2E9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
RRBP1Q9P2E9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
RRBP1Q9P2E9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
RRBP1Q9P2E9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
RRBP1Q9P2E9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
RRBP1Q9P2E9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
RRBP1Q9P2E9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
RRBP1Q9P2E9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
RRBP1Q9P2E9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
RRBP1Q9P2E9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
RRBP1Q9P2E9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
RRBP1Q9P2E9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
RRBP1Q9P2E9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
RRBP1Q9P2E9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
RRBP1Q9P2E9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.65■■■■■ 4.1
RRBP1Q9P2E9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
RRBP1Q9P2E9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
RRBP1Q9P2E9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
RRBP1Q9P2E9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
RRBP1Q9P2E9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
RRBP1Q9P2E9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
RRBP1Q9P2E9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
RRBP1Q9P2E9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
RRBP1Q9P2E9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC40.6■■■■■ 4.09
RRBP1Q9P2E9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
RRBP1Q9P2E9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
RRBP1Q9P2E9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
RRBP1Q9P2E9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
RRBP1Q9P2E9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
RRBP1Q9P2E9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
RRBP1Q9P2E9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
RRBP1Q9P2E9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
RRBP1Q9P2E9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
RRBP1Q9P2E9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
RRBP1Q9P2E9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
RRBP1Q9P2E9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
RRBP1Q9P2E9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
RRBP1Q9P2E9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
RRBP1Q9P2E9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
RRBP1Q9P2E9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
RRBP1Q9P2E9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
RRBP1Q9P2E9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
RRBP1Q9P2E9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
RRBP1Q9P2E9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
RRBP1Q9P2E9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
RRBP1Q9P2E9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
RRBP1Q9P2E9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
RRBP1Q9P2E9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC40.49■■■■■ 4.07
RRBP1Q9P2E9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
RRBP1Q9P2E9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
RRBP1Q9P2E9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
RRBP1Q9P2E9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
RRBP1Q9P2E9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
RRBP1Q9P2E9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
RRBP1Q9P2E9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
RRBP1Q9P2E9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
RRBP1Q9P2E9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
RRBP1Q9P2E9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
RRBP1Q9P2E9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
RRBP1Q9P2E9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
RRBP1Q9P2E9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
RRBP1Q9P2E9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
RRBP1Q9P2E9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
RRBP1Q9P2E9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
RRBP1Q9P2E9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
RRBP1Q9P2E9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
RRBP1Q9P2E9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
RRBP1Q9P2E9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
RRBP1Q9P2E9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
RRBP1Q9P2E9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
RRBP1Q9P2E9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RRBP1Q9P2E9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RRBP1Q9P2E9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC40.32■■■■■ 4.04
RRBP1Q9P2E9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
RRBP1Q9P2E9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
RRBP1Q9P2E9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
RRBP1Q9P2E9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms