Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HACD3Q9P035 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HACD3Q9P035 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HACD3Q9P035 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HACD3Q9P035 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HACD3Q9P035 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HACD3Q9P035 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HACD3Q9P035 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HACD3Q9P035 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HACD3Q9P035 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HACD3Q9P035 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HACD3Q9P035 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
HACD3Q9P035 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HACD3Q9P035 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HACD3Q9P035 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HACD3Q9P035 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HACD3Q9P035 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HACD3Q9P035 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HACD3Q9P035 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HACD3Q9P035 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HACD3Q9P035 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HACD3Q9P035 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HACD3Q9P035 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HACD3Q9P035 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HACD3Q9P035 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HACD3Q9P035 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HACD3Q9P035 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HACD3Q9P035 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HACD3Q9P035 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HACD3Q9P035 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HACD3Q9P035 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HACD3Q9P035 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HACD3Q9P035 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HACD3Q9P035 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HACD3Q9P035 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HACD3Q9P035 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HACD3Q9P035 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HACD3Q9P035 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HACD3Q9P035 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HACD3Q9P035 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HACD3Q9P035 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HACD3Q9P035 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HACD3Q9P035 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HACD3Q9P035 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HACD3Q9P035 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HACD3Q9P035 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HACD3Q9P035 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HACD3Q9P035 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HACD3Q9P035 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HACD3Q9P035 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HACD3Q9P035 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HACD3Q9P035 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HACD3Q9P035 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HACD3Q9P035 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HACD3Q9P035 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HACD3Q9P035 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HACD3Q9P035 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HACD3Q9P035 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HACD3Q9P035 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HACD3Q9P035 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HACD3Q9P035 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HACD3Q9P035 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HACD3Q9P035 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HACD3Q9P035 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HACD3Q9P035 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HACD3Q9P035 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HACD3Q9P035 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HACD3Q9P035 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HACD3Q9P035 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HACD3Q9P035 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HACD3Q9P035 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HACD3Q9P035 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HACD3Q9P035 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HACD3Q9P035 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HACD3Q9P035 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HACD3Q9P035 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HACD3Q9P035 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HACD3Q9P035 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HACD3Q9P035 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HACD3Q9P035 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACD3Q9P035 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACD3Q9P035 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACD3Q9P035 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACD3Q9P035 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACD3Q9P035 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACD3Q9P035 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACD3Q9P035 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HACD3Q9P035 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HACD3Q9P035 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HACD3Q9P035 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HACD3Q9P035 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HACD3Q9P035 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HACD3Q9P035 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HACD3Q9P035 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HACD3Q9P035 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HACD3Q9P035 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HACD3Q9P035 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HACD3Q9P035 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HACD3Q9P035 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HACD3Q9P035 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms