Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI8

IGF2BP1, Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGF2BP1Q9NZI8 CCNDBP1-215ENST00000569745 1356 ntTSL 516.23■□□□□ 0.191e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 CCNDBP1-213ENST00000568507 1385 ntTSL 214.75□□□□□ -0.051e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.061e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 CNOT6L-207ENST00000515441 572 ntTSL 414.64□□□□□ -0.071e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 CCNDBP1-206ENST00000565296 1831 ntTSL 213.82□□□□□ -0.21e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 CNOT6L-204ENST00000506166 781 ntTSL 210.64□□□□□ -0.711e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 CNOT6L-208ENST00000515506 4024 ntTSL 59.92□□□□□ -0.821e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 CCNDBP1-202ENST00000444658 1479 ntTSL 29.29□□□□□ -0.921e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 TBL1XR1-220ENST00000630796 656 ntTSL 56.71□□□□□ -1.341e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 CCNDBP1-207ENST00000565958 750 ntTSL 26.47□□□□□ -1.371e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 CNOT6L-202ENST00000504804 1925 ntTSL 56.09□□□□□ -1.431e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 CNOT6L-206ENST00000512485 1890 ntTSL 55.74□□□□□ -1.491e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.841e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.715e-7■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 RTL8A-204ENST00000522309 536 ntTSL 1 (best)16.69■□□□□ 0.265e-7■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 RTL8A-203ENST00000520964 817 ntTSL 39.99□□□□□ -0.815e-7■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 RTL8A-202ENST00000518153 762 ntTSL 26.04□□□□□ -1.445e-7■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 GPC3-203ENST00000406757 836 ntTSL 28.35□□□□□ -1.075e-7■■■■■ 39.3
IGF2BP1Q9NZI8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.42e-12■■■■■ 39.3
IGF2BP1Q9NZI8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.312e-12■■■■■ 39.3
IGF2BP1Q9NZI8 ATP5C1-209ENST00000480528 460 ntTSL 24.95□□□□□ -1.628e-17■■■■■ 39.2
IGF2BP1Q9NZI8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.244e-12■■■■■ 39.2
IGF2BP1Q9NZI8 GYPA-210ENST00000514603 613 ntTSL 56.58□□□□□ -1.361e-14■■■■■ 39.2
IGF2BP1Q9NZI8 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC13.88□□□□□ -0.192e-10■■■■■ 39.1
IGF2BP1Q9NZI8 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt11.17□□□□□ -0.622e-10■■■■■ 39.1
IGF2BP1Q9NZI8 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt11.11□□□□□ -0.632e-10■■■■■ 39.1
IGF2BP1Q9NZI8 CPD-209ENST00000584221 680 ntTSL 35.8□□□□□ -1.486e-7■■■■■ 39.1
IGF2BP1Q9NZI8 VDAC2-212ENST00000481876 822 ntTSL 316.11■□□□□ 0.173e-7■■■■■ 39
IGF2BP1Q9NZI8 VDAC2-204ENST00000344036 681 ntTSL 314.96□□□□□ -0.013e-7■■■■■ 39
IGF2BP1Q9NZI8 VDAC2-208ENST00000468285 850 ntTSL 214.34□□□□□ -0.113e-7■■■■■ 39
IGF2BP1Q9NZI8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.881e-8■■■■■ 39
IGF2BP1Q9NZI8 NIPSNAP2-208ENST00000470036 497 ntTSL 219.49■□□□□ 0.717e-9■■■■■ 38.9
IGF2BP1Q9NZI8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.432e-8■■■■■ 38.9
IGF2BP1Q9NZI8 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.42e-8■■■■■ 38.9
IGF2BP1Q9NZI8 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.052e-8■■■■■ 38.9
IGF2BP1Q9NZI8 PSMA1-207ENST00000528307 1394 ntTSL 57.04□□□□□ -1.282e-8■■■■■ 38.9
IGF2BP1Q9NZI8 KPNA3-201ENST00000261667 4474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.685e-12■■■■■ 38.9
IGF2BP1Q9NZI8 KPNA3-202ENST00000436760 588 ntTSL 26.4□□□□□ -1.385e-12■■■■■ 38.9
IGF2BP1Q9NZI8 NUSAP1-211ENST00000560318 485 ntTSL 513.15□□□□□ -0.31e-12■■■■■ 38.8
IGF2BP1Q9NZI8 NUSAP1-213ENST00000560898 708 ntTSL 36.82□□□□□ -1.321e-12■■■■■ 38.8
IGF2BP1Q9NZI8 KDELR2-204ENST00000462052 382 ntTSL 27.85□□□□□ -1.157e-10■■■■■ 38.7
IGF2BP1Q9NZI8 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.271e-15■■■■■ 38.7
IGF2BP1Q9NZI8 TMEM123-205ENST00000528969 568 ntAPPRIS ALT2 TSL 44.69□□□□□ -1.661e-15■■■■■ 38.7
IGF2BP1Q9NZI8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.534e-7■■■■■ 38.7
IGF2BP1Q9NZI8 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.114e-7■■■■■ 38.7
IGF2BP1Q9NZI8 TAB2-203ENST00000470466 4199 ntTSL 1 (best)6.51□□□□□ -1.374e-7■■■■■ 38.7
IGF2BP1Q9NZI8 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.984e-7■■■■■ 38.7
IGF2BP1Q9NZI8 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.064e-7■■■■■ 38.7
IGF2BP1Q9NZI8 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -01e-11■■■■■ 38.7
IGF2BP1Q9NZI8 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.051e-11■■■■■ 38.7
IGF2BP1Q9NZI8 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.251e-11■■■■■ 38.7
IGF2BP1Q9NZI8 AL132671.2-201ENST00000467125 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.781e-11■■■■■ 38.7
IGF2BP1Q9NZI8 SEC31A-240ENST00000515062 597 ntTSL 36.63□□□□□ -1.352e-9■■■■■ 38.7
IGF2BP1Q9NZI8 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.287e-30■■■■■ 38.6
IGF2BP1Q9NZI8 PSMA1-204ENST00000526443 569 ntTSL 26.68□□□□□ -1.344e-8■■■■■ 38.5
IGF2BP1Q9NZI8 CCNY-207ENST00000490012 793 ntTSL 314.91□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 38.5
IGF2BP1Q9NZI8 FKBP1A-206ENST00000460490 694 ntTSL 28.83□□□□□ -14e-9■■■■■ 38.5
IGF2BP1Q9NZI8 FKBP1A-203ENST00000381724 976 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.264e-9■■■■■ 38.5
IGF2BP1Q9NZI8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.682e-7■■■■■ 38.4
IGF2BP1Q9NZI8 LINC00511-202ENST00000457958 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 38.4
IGF2BP1Q9NZI8 LINC00511-210ENST00000580861 467 ntTSL 48.84□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 38.4
IGF2BP1Q9NZI8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.062e-12■■■■■ 38.3
IGF2BP1Q9NZI8 CCNG1-207ENST00000510097 564 ntTSL 414.77□□□□□ -0.055e-24■■■■■ 38.3
IGF2BP1Q9NZI8 C1orf174-202ENST00000474140 3499 ntTSL 514.71□□□□□ -0.062e-12■■■■■ 38.3
IGF2BP1Q9NZI8 C1orf174-203ENST00000486765 2517 ntTSL 514.05□□□□□ -0.162e-12■■■■■ 38.3
IGF2BP1Q9NZI8 COPZ1-204ENST00000548281 554 ntTSL 411.65□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 38.3
IGF2BP1Q9NZI8 COPZ1-213ENST00000551962 578 ntTSL 511.22□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 38.3
IGF2BP1Q9NZI8 COPZ1-208ENST00000550027 553 ntTSL 1 (best)8.72□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 38.3
IGF2BP1Q9NZI8 COPZ1-210ENST00000550713 548 ntTSL 28.4□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 38.3
IGF2BP1Q9NZI8 COPZ1-215ENST00000552362 575 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.132e-7■■■■■ 38.3
IGF2BP1Q9NZI8 COPZ1-211ENST00000551412 548 ntTSL 27.9□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 38.3
IGF2BP1Q9NZI8 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.332e-7■■■■■ 38.3
IGF2BP1Q9NZI8 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.33e-7■■■■■ 38.2
IGF2BP1Q9NZI8 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.453e-7■■■■■ 38.2
IGF2BP1Q9NZI8 PSMA1-211ENST00000531156 574 ntTSL 48.99□□□□□ -0.974e-8■■■■■ 38.2
IGF2BP1Q9NZI8 LYRM4-204ENST00000463032 1487 ntTSL 1 (best)13.46□□□□□ -0.259e-12■■■■■ 38.2
IGF2BP1Q9NZI8 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.39e-12■■■■■ 38.2
IGF2BP1Q9NZI8 LYRM4-203ENST00000458438 941 ntTSL 212.61□□□□□ -0.399e-12■■■■■ 38.2
IGF2BP1Q9NZI8 LYRM4-205ENST00000464010 1401 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.479e-12■■■■■ 38.2
IGF2BP1Q9NZI8 PKP4-208ENST00000462335 561 ntTSL 49.55□□□□□ -0.889e-12■■■■■ 38.2
IGF2BP1Q9NZI8 SLC2A3-205ENST00000486749 4414 ntTSL 1 (best)8.64□□□□□ -1.034e-11■■■■■ 38.2
IGF2BP1Q9NZI8 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.059e-12■■■■■ 38.2
IGF2BP1Q9NZI8 SLC2A3-201ENST00000075120 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.134e-11■■■■■ 38.2
IGF2BP1Q9NZI8 SLC2A3-202ENST00000469295 1030 ntTSL 27.27□□□□□ -1.254e-11■■■■■ 38.2
IGF2BP1Q9NZI8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.642e-14■■■■■ 38.1
IGF2BP1Q9NZI8 LAMP1-203ENST00000472564 5242 ntTSL 217.4■□□□□ 0.382e-14■■■■■ 38.1
IGF2BP1Q9NZI8 PTPN12-202ENST00000407343 704 ntTSL 39.07□□□□□ -0.961e-8■■■■■ 37.9
IGF2BP1Q9NZI8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.932e-8■■■■■ 37.9
IGF2BP1Q9NZI8 CABIN1-206ENST00000454754 1321 ntTSL 1 (best)19.73■□□□□ 0.752e-11■■■■■ 37.9
IGF2BP1Q9NZI8 CABIN1-205ENST00000445422 1472 ntTSL 219.14■□□□□ 0.652e-11■■■■■ 37.9
IGF2BP1Q9NZI8 KEL-208ENST00000479768 1856 ntTSL 513.55□□□□□ -0.242e-11■■■■■ 37.9
IGF2BP1Q9NZI8 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.522e-11■■■■■ 37.9
IGF2BP1Q9NZI8 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.532e-11■■■■■ 37.9
IGF2BP1Q9NZI8 CABIN1-204ENST00000405822 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.592e-11■■■■■ 37.9
IGF2BP1Q9NZI8 CABIN1-214ENST00000617531 7072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.652e-11■■■■■ 37.9
IGF2BP1Q9NZI8 KEL-201ENST00000355265 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.932e-11■■■■■ 37.9
IGF2BP1Q9NZI8 HELLS-203ENST00000371327 4987 ntTSL 23.42□□□□□ -1.862e-11■■■■■ 37.9
IGF2BP1Q9NZI8 NDC1-202ENST00000480952 785 ntTSL 312.95□□□□□ -0.347e-9■■■■■ 37.9
IGF2BP1Q9NZI8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.556e-11■■■■■ 37.8
IGF2BP1Q9NZI8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.024e-9■■■■■ 37.8
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