Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNK4Q9NYG8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNK4Q9NYG8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNK4Q9NYG8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNK4Q9NYG8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNK4Q9NYG8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNK4Q9NYG8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNK4Q9NYG8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNK4Q9NYG8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNK4Q9NYG8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNK4Q9NYG8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNK4Q9NYG8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNK4Q9NYG8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNK4Q9NYG8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNK4Q9NYG8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNK4Q9NYG8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNK4Q9NYG8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNK4Q9NYG8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNK4Q9NYG8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNK4Q9NYG8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNK4Q9NYG8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNK4Q9NYG8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNK4Q9NYG8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNK4Q9NYG8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNK4Q9NYG8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNK4Q9NYG8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNK4Q9NYG8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNK4Q9NYG8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNK4Q9NYG8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNK4Q9NYG8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNK4Q9NYG8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNK4Q9NYG8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNK4Q9NYG8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNK4Q9NYG8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNK4Q9NYG8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNK4Q9NYG8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNK4Q9NYG8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNK4Q9NYG8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNK4Q9NYG8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNK4Q9NYG8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNK4Q9NYG8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNK4Q9NYG8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNK4Q9NYG8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNK4Q9NYG8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNK4Q9NYG8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNK4Q9NYG8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNK4Q9NYG8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNK4Q9NYG8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNK4Q9NYG8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNK4Q9NYG8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNK4Q9NYG8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNK4Q9NYG8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNK4Q9NYG8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNK4Q9NYG8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNK4Q9NYG8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNK4Q9NYG8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNK4Q9NYG8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNK4Q9NYG8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNK4Q9NYG8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNK4Q9NYG8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNK4Q9NYG8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNK4Q9NYG8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNK4Q9NYG8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNK4Q9NYG8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNK4Q9NYG8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNK4Q9NYG8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNK4Q9NYG8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNK4Q9NYG8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNK4Q9NYG8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNK4Q9NYG8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNK4Q9NYG8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNK4Q9NYG8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNK4Q9NYG8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNK4Q9NYG8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNK4Q9NYG8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNK4Q9NYG8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNK4Q9NYG8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNK4Q9NYG8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNK4Q9NYG8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNK4Q9NYG8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNK4Q9NYG8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNK4Q9NYG8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNK4Q9NYG8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNK4Q9NYG8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNK4Q9NYG8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNK4Q9NYG8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNK4Q9NYG8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNK4Q9NYG8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNK4Q9NYG8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KCNK4Q9NYG8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNK4Q9NYG8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNK4Q9NYG8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNK4Q9NYG8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNK4Q9NYG8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNK4Q9NYG8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNK4Q9NYG8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNK4Q9NYG8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNK4Q9NYG8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNK4Q9NYG8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNK4Q9NYG8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms