Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PPP4R2Q9NY27 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PPP4R2Q9NY27 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PPP4R2Q9NY27 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PPP4R2Q9NY27 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PPP4R2Q9NY27 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PPP4R2Q9NY27 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PPP4R2Q9NY27 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PPP4R2Q9NY27 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PPP4R2Q9NY27 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PPP4R2Q9NY27 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PPP4R2Q9NY27 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PPP4R2Q9NY27 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PPP4R2Q9NY27 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PPP4R2Q9NY27 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PPP4R2Q9NY27 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PPP4R2Q9NY27 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
PPP4R2Q9NY27 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PPP4R2Q9NY27 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PPP4R2Q9NY27 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PPP4R2Q9NY27 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PPP4R2Q9NY27 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PPP4R2Q9NY27 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PPP4R2Q9NY27 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PPP4R2Q9NY27 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PPP4R2Q9NY27 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PPP4R2Q9NY27 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PPP4R2Q9NY27 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PPP4R2Q9NY27 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PPP4R2Q9NY27 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PPP4R2Q9NY27 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PPP4R2Q9NY27 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPP4R2Q9NY27 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPP4R2Q9NY27 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PPP4R2Q9NY27 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PPP4R2Q9NY27 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PPP4R2Q9NY27 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PPP4R2Q9NY27 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PPP4R2Q9NY27 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PPP4R2Q9NY27 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPP4R2Q9NY27 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PPP4R2Q9NY27 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PPP4R2Q9NY27 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PPP4R2Q9NY27 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PPP4R2Q9NY27 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PPP4R2Q9NY27 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PPP4R2Q9NY27 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PPP4R2Q9NY27 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PPP4R2Q9NY27 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PPP4R2Q9NY27 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PPP4R2Q9NY27 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PPP4R2Q9NY27 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PPP4R2Q9NY27 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PPP4R2Q9NY27 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PPP4R2Q9NY27 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PPP4R2Q9NY27 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
PPP4R2Q9NY27 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PPP4R2Q9NY27 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PPP4R2Q9NY27 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PPP4R2Q9NY27 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PPP4R2Q9NY27 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PPP4R2Q9NY27 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PPP4R2Q9NY27 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PPP4R2Q9NY27 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PPP4R2Q9NY27 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PPP4R2Q9NY27 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PPP4R2Q9NY27 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PPP4R2Q9NY27 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PPP4R2Q9NY27 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PPP4R2Q9NY27 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PPP4R2Q9NY27 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PPP4R2Q9NY27 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PPP4R2Q9NY27 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PPP4R2Q9NY27 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPP4R2Q9NY27 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPP4R2Q9NY27 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPP4R2Q9NY27 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PPP4R2Q9NY27 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PPP4R2Q9NY27 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PPP4R2Q9NY27 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PPP4R2Q9NY27 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PPP4R2Q9NY27 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PPP4R2Q9NY27 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PPP4R2Q9NY27 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PPP4R2Q9NY27 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PPP4R2Q9NY27 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PPP4R2Q9NY27 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PPP4R2Q9NY27 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PPP4R2Q9NY27 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PPP4R2Q9NY27 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PPP4R2Q9NY27 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PPP4R2Q9NY27 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PPP4R2Q9NY27 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PPP4R2Q9NY27 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PPP4R2Q9NY27 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PPP4R2Q9NY27 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PPP4R2Q9NY27 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PPP4R2Q9NY27 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PPP4R2Q9NY27 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PPP4R2Q9NY27 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms