Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A12Q9NXJ0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A12Q9NXJ0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A12Q9NXJ0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A12Q9NXJ0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A12Q9NXJ0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A12Q9NXJ0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A12Q9NXJ0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A12Q9NXJ0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A12Q9NXJ0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A12Q9NXJ0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A12Q9NXJ0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A12Q9NXJ0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A12Q9NXJ0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A12Q9NXJ0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A12Q9NXJ0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A12Q9NXJ0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A12Q9NXJ0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A12Q9NXJ0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A12Q9NXJ0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A12Q9NXJ0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A12Q9NXJ0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A12Q9NXJ0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A12Q9NXJ0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A12Q9NXJ0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A12Q9NXJ0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A12Q9NXJ0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A12Q9NXJ0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A12Q9NXJ0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A12Q9NXJ0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A12Q9NXJ0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A12Q9NXJ0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A12Q9NXJ0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A12Q9NXJ0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A12Q9NXJ0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A12Q9NXJ0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A12Q9NXJ0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A12Q9NXJ0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A12Q9NXJ0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A12Q9NXJ0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A12Q9NXJ0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A12Q9NXJ0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A12Q9NXJ0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MS4A12Q9NXJ0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MS4A12Q9NXJ0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MS4A12Q9NXJ0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A12Q9NXJ0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A12Q9NXJ0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A12Q9NXJ0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A12Q9NXJ0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A12Q9NXJ0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A12Q9NXJ0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A12Q9NXJ0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A12Q9NXJ0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A12Q9NXJ0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A12Q9NXJ0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A12Q9NXJ0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A12Q9NXJ0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A12Q9NXJ0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A12Q9NXJ0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MS4A12Q9NXJ0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A12Q9NXJ0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A12Q9NXJ0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A12Q9NXJ0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A12Q9NXJ0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A12Q9NXJ0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A12Q9NXJ0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A12Q9NXJ0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A12Q9NXJ0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A12Q9NXJ0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A12Q9NXJ0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A12Q9NXJ0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A12Q9NXJ0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A12Q9NXJ0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A12Q9NXJ0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A12Q9NXJ0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A12Q9NXJ0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A12Q9NXJ0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A12Q9NXJ0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A12Q9NXJ0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A12Q9NXJ0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A12Q9NXJ0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A12Q9NXJ0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A12Q9NXJ0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A12Q9NXJ0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A12Q9NXJ0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A12Q9NXJ0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A12Q9NXJ0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A12Q9NXJ0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A12Q9NXJ0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A12Q9NXJ0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A12Q9NXJ0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A12Q9NXJ0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A12Q9NXJ0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A12Q9NXJ0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A12Q9NXJ0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A12Q9NXJ0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A12Q9NXJ0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A12Q9NXJ0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms