Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHCHD3Q9NX63 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHCHD3Q9NX63 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHCHD3Q9NX63 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHCHD3Q9NX63 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHCHD3Q9NX63 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHCHD3Q9NX63 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHCHD3Q9NX63 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHCHD3Q9NX63 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHCHD3Q9NX63 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHCHD3Q9NX63 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHCHD3Q9NX63 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHCHD3Q9NX63 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHCHD3Q9NX63 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHCHD3Q9NX63 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHCHD3Q9NX63 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHCHD3Q9NX63 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHCHD3Q9NX63 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHCHD3Q9NX63 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHCHD3Q9NX63 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHCHD3Q9NX63 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHCHD3Q9NX63 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHCHD3Q9NX63 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHCHD3Q9NX63 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHCHD3Q9NX63 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHCHD3Q9NX63 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHCHD3Q9NX63 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHCHD3Q9NX63 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHCHD3Q9NX63 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHCHD3Q9NX63 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHCHD3Q9NX63 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHCHD3Q9NX63 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHCHD3Q9NX63 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHCHD3Q9NX63 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHCHD3Q9NX63 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHCHD3Q9NX63 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHCHD3Q9NX63 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHCHD3Q9NX63 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHCHD3Q9NX63 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHCHD3Q9NX63 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHCHD3Q9NX63 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHCHD3Q9NX63 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHCHD3Q9NX63 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHCHD3Q9NX63 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHCHD3Q9NX63 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHCHD3Q9NX63 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHCHD3Q9NX63 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHCHD3Q9NX63 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHCHD3Q9NX63 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHCHD3Q9NX63 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHCHD3Q9NX63 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHCHD3Q9NX63 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHCHD3Q9NX63 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHCHD3Q9NX63 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHCHD3Q9NX63 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHCHD3Q9NX63 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHCHD3Q9NX63 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHCHD3Q9NX63 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHCHD3Q9NX63 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHCHD3Q9NX63 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHCHD3Q9NX63 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHCHD3Q9NX63 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHCHD3Q9NX63 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHCHD3Q9NX63 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHCHD3Q9NX63 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHCHD3Q9NX63 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHCHD3Q9NX63 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHCHD3Q9NX63 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHCHD3Q9NX63 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHCHD3Q9NX63 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHCHD3Q9NX63 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHCHD3Q9NX63 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHCHD3Q9NX63 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHCHD3Q9NX63 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHCHD3Q9NX63 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHCHD3Q9NX63 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHCHD3Q9NX63 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHCHD3Q9NX63 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHCHD3Q9NX63 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHCHD3Q9NX63 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHCHD3Q9NX63 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHCHD3Q9NX63 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHCHD3Q9NX63 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHCHD3Q9NX63 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHCHD3Q9NX63 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHCHD3Q9NX63 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHCHD3Q9NX63 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHCHD3Q9NX63 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHCHD3Q9NX63 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHCHD3Q9NX63 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHCHD3Q9NX63 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHCHD3Q9NX63 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHCHD3Q9NX63 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHCHD3Q9NX63 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHCHD3Q9NX63 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHCHD3Q9NX63 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHCHD3Q9NX63 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHCHD3Q9NX63 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHCHD3Q9NX63 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHCHD3Q9NX63 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.8 ms